Giai đoạn 1991-1993:
1. GS-TSKH Trần Hữu Phát Viện trưởng
2. PGS-TS Trần Thanh Minh Phó Viện trưởng
3 TS Huỳnh Thượng Hiệp Phó Viện trưởng
Giai đoạn 1994-1997:
1. PGS-TS Trần Thanh Minh Viện trưởng
2. PGS-TS Hoàng Đắc Lực Phó Viện trưởng
3. TS Huỳnh Thượng Hiệp Phó Viện trưởng
Giai đoạn 1998- 2001:
1. TS Võ Văn Thuận Viện trưởng
2. TS Hà Văn Thông Phó Viện trưởng
3. KS Phạm Quang Điện Phó Viện trưởng (Mất năm 1999)
4. PGS-TS Trần Đại Nghiệp Phó Viện trưởng
Giai đoạn 2001- 2005:
1. TS Võ Văn Thuận Viện trưởng
2. TS Hà Văn Thông Phó Viện trưởng
3. TS Đặng Đức Nhận Phó Viện trưởng
Giai đoạn 2006- 2008:
1. TS Lê Văn Hồng Viện trưởng
2. TS Hoàng Hoa Mai Phó Viện trưởng
3. TS Trịnh Văn Giáp Phó Viện trưởng
Giai đoạn từ 2008 đến 2010:
1. TS Trịnh Văn Giáp Viện trưởng
2. TS Hoàng Hoa Mai Phó Viện trưởng
3. KS Đặng Hoàn Thành Phó Viện trưởng
Giai đoạn từ 2010 đến 5/2013:
1. TS Trịnh Văn Giáp Viện trưởng
2. KS Đặng Hoàn Thành Phó Viện trưởng
3. TS. Đặng Quang Thiệu Phó Viện trưởng
Giai đoạn từ 8/2013 đến tháng 5/2016
1. TS. Trịnh Văn Giáp Viện trưởng
2. KS. Đặng Hoàn Thành Phó Viện trưởng
3. TS. Nguyễn Tuấn Khải Phó Viện trưởng
Giai đoạn từ 6/2016 đến tháng 10/2016
1. TS. Trịnh Văn Giáp Viện trưởng
2. KS. Đặng Hoàn Thành Phó Viện trưởng
3. TS. Nguyễn Tuấn Khải Phó Viện trưởng
4. ThS. Nguyễn Hữu Quyết Phó Viện trưởng
Giai đoạn từ 11/2016 đến tháng 5/2017
1. TS. Trịnh Văn Giáp Viện trưởng
2. KS. Đặng Hoàn Thành Phó Viện trưởng
3. ThS. Nguyễn Hữu Quyết Phó Viện trưởng
Giai đoạn từ 6/2017 đến tháng 7/2017
1. TS. Trịnh Văn Giáp Viện trưởng
2. KS. Đặng Hoàn Thành Phó Viện trưởng
3. ThS. Nguyễn Hữu Quyết Phó Viện trưởng
4. PGS.TS. Phạm Đức Khuê Phó Viện trưởng
Giai đoạn từ 7/2017 đến tháng 6/2018
1. TS. Trịnh Văn Giáp Viện trưởng
2. ThS. Nguyễn Hữu Quyết Phó Viện trưởng
3. PGS.TS. Phạm Đức Khuê Phó Viện trưởng
Giai đoạn từ 7/2018 đến 5/2020
1. PGS.TS. Phạm Đức Khuê Phó Viện trưởng, Phụ trách Viện
2. ThS. Nguyễn Hữu Quyết Phó Viện trưởng
Giai đoạn từ 5/2020 đến 6/2021
1. PGS.TS. Phạm Đức Khuê Viện trưởng
2. ThS. Nguyễn Hữu Quyết Phó Viện trưởng
Giai đoạn từ 6/2021 đến nay
1. PGS.TS. Phạm Đức Khuê Viện trưởng
2. TS. Nguyễn Hữu Quyết Phó Viện trưởng
3. TS. Phạm Ngọc Đồng Phó Viện trưởng
