Phụ trách chung và chịu trách nhiệm toàn bộ các hoạt động của Viện theo quy định của chế độ thủ trưởng và các quy định khác của Viện Năng lượng nguyên tử Việt Nam, Bộ Khoa học và Công nghệ, trực tiếp chỉ đạo các đơn vị và lĩnh vực công tác sau:
1. Lĩnh vực phụ trách:
- Công tác tổ chức cán bộ và phát triển nguồn nhân lực;
- Công tác kế hoạch tài chính, tăng cường tiềm lực;
- Công tác nghiên cứu triển khai;
- Công tác hợp tác quốc tế, hợp tác trong nước;
- Công tác an toàn bức xạ với tư cách là chủ cơ sở bức xạ;
- Đề tài, nhiệm vụ KHCN cấp Nhà nước, cấp Bộ;
- Đảm bảo mối liên hệ giữa Ban Lãnh đạo Viện với Đảng ủy và các tổ chức đoàn thể;
- Công tác thi đua khen thưởng.
2. Các đơn vị phụ trách:
- Phòng Kế hoạch Hợp tác quốc tế;
- Trung tâm Vật lý hạt nhân;
- Trung tâm Năng lượng hạt nhân;
